Društvo je osnovano odmah nakon Drugoga svjetskog rata, 1946. g., u Zagrebu, kao prvo na tlu tadašnje novostvorene, bivše Federativne Jugoslavije. Prvo službeno ime Društva bilo je Društvo službenika i suradnika muzeja, galerija i konzervatorskih zavoda Museion u NR Hrvatskoj. Već od samih početaka osnivaju se podružnice i radne sekcije.Godine 1948. pokrenuta je inicijativa za izdavanje stručnog glasila Društva, a realizirana je 4 godine kasnije, u travnju 1952., izlaskom prvog broja Vijesti muzealaca i konzervatora SR Hrvatske.
Godine 1959. osniva se samostalno Društvo konzervatora Hrvatske i odvaja se od Muzejskog društva te Društvo od tada nosi naziv Muzejsko društvo NR Hrvatske, ali glasilo i dalje u svom nazivu zadržava pojam konzervatori, što je i danas slučaj. Godine 1960. utvrđuje se kao novi naziv Muzejsko društvo Hrvatske, a 1975. ono se registriralo kao Savez muzejskih društava Hrvatske. U razdoblju između 1991. i 1997. (razdoblje osamostaljenja i agresije na Hrvatsku) Društvo je djelovalo tek sporadično, a glasilo Vijesti muzealaca i konzervatora nije izlazilo (prvi broj nakon 6 godina pauze tiskan je 1997). Rad Društva obnovljen je 1996., a službeno je registrirano kao Hrvatsko muzejsko društvo 1998. prihvaćanjem Statuta i upisom u Registar udruga RH pri Ministarstvu uprave.